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Que savez-vous de l'application des perles magnétiques ?
Que savez-vous de l'application des perles magnétiques ?
Basé sur la technologie SPRI, dans le système de réaction de la méthode des billes magnétiques, les molécules d'acide nucléique (ADN et ARN) seront comprimées de la forme linéaire à la forme sphérique. L'ADN subira des changements spectaculaires dans sa conformation moléculaire, favorisés par le NaCl ou le MgCl2 en présence d'une certaine concentration de PEG. Un grand nombre de groupes phosphate chargés négativement sur le squelette phosphate se lieront aux billes magnétiques carboxyle chargées négativement à la surface. On pense actuellement que cette interaction entre les charges négatives et négatives est due à l'action des ions de sel chargés positivement (par exemple, Na+). Le groupe phosphate chargé négativement forme une structure de pont salin "anion-cation-anion" avec le groupe carboxyle par l'intermédiaire de l'ion sel dissocié (par exemple Na+), de sorte que l'ADN est spécifiquement adsorbé à la surface des billes carboxyle. Lorsque le tampon de réaction est éliminé, l'ajout de molécules d'eau hydrate rapidement et complètement les molécules d'acide nucléique et libère l'interaction ionique entre les trois, ce qui permet la purification des molécules d'acide nucléique adsorbées sur les billes magnétiques. En utilisant les propriétés magnétiques des billes magnétiques, les fragments d'ADN peuvent être collectés et élués par un champ magnétique appliqué.
Profitant du développement de la technologie de séquençage à haut débit, les billes magnétiques sont également très appréciées pour leur haut débit et leur applicabilité à l'automatisation. En outre, les billes magnétiques sont largement utilisées pour la purification de l'ADN et la sélection de la taille du double tour (criblage des fragments) dans la préparation des bibliothèques de séquençage de nouvelle génération (NGS).
L'objectif de la purification de l'ADN est d'éliminer les fragments indésirables et de récupérer les fragments requis. Il faut donc jeter le surnageant et conserver les billes magnétiques, puis laver et éluer. Comme les billes absorbent préférentiellement les gros fragments, un certain pourcentage de billes peut être utilisé pour attirer les fragments d'ADN au-dessus d'une certaine taille. Le surnageant (fragments d'ADN non ciblés) est jeté et les billes sont éluées pour récupérer l'ADN absorbé.
L'objectif de la sélection de la taille des fragments d'ADN (criblage des fragments) est de sélectionner des fragments d'ADN de taille spécifique. Étant donné que les billes adsorbent de préférence les gros fragments, la sélection par taille est effectuée par deux tours de manipulation des billes.
Billes magnétiques BunnyMagTM
Les billes magnétiques du BunnyMagTM DNA Purification & Size-Selection Beads développé par BunnyTeeth Inc. sont similaires à la plupart des billes magnétiques du marché
Structure des perles magnétiques BunnyMagTM（3-couche）：
Le noyau le plus interne est en polystyrène (PS)
La deuxième couche est enveloppée d'un matériau magnétique--Fe3O4
La surface la plus externe est un polymère modifié par des groupes carboxyle（-COOH）
Composition principale : Perles superparamagnétiques、Polyéthylène glycol（PEG）、NaCl
Avantages des billes magnétiques BunnyMagTM
(1) Faible besoin en échantillons : une concentration élevée d'acides nucléiques peut être extraite à partir d'une quantité infime de matériel.
(2) Opération simple et rapide : l'ensemble du processus d'opération est essentiellement divisé en cinq étapes (lyse, liaison, lavage, séchage, élution), et l'ensemble du processus peut être achevé en 30-60 minutes sans opération centrifuge principalement.
(3) Qualité stable et fiable : les billes magnétiques libres absorbent plus d'acides nucléiques, et la liaison spécifique rend la pureté des acides nucléiques plus élevée, et la récupération des acides nucléiques peut être ajustée en contrôlant les groupes de surface des billes magnétiques.
(4) Fonctionnement entièrement automatisé : l'extracteur d'acide nucléique peut être utilisé pour réaliser un fonctionnement automatisé à haut débit, et réaliser l'extraction de dizaines, voire de centaines d'échantillons.
(5) Sûr, non toxique et inoffensif : les réactifs ne contiennent pas de phénol, de chloroforme et d'autres réactifs chimiques toxiques, ce qui est totalement conforme au concept moderne de protection de l'environnement.
