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Le nouveau test Covid-19 basé sur le CRISPR pourrait changer la donne

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Un nouveau test basé sur la technologie de ciblage des gènes CRISPR pourrait diagnostiquer les infections à Covid-19 en 45 minutes. Il a récemment été présenté dans un article de la revue Nature Biotechnology.

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Dans le monde actuel ravagé par les pandémies, se réveiller avec une légère toux ou une légère fièvre peut être à la fois extrêmement inquiétant et très perturbateur. Avec des symptômes aussi peu spécifiques, la seule façon de déterminer si la personne souffre d'un rhume ou d'un syndrome Covid-19 est d'effectuer un test de diagnostic. Avec des pays qui cherchent maintenant à assouplir les périodes de confinement et les mesures de distanciation sociale dès que possible, la nécessité de tester les infections à coronavirus rapidement, à moindre coût et à grande échelle n'a jamais été aussi urgente.

Heureusement, l'aide peut être à portée de main, sous la forme d'un nouveau test basé sur la technologie de ciblage des gènes, appelé CRISPR. Selon les chercheurs, ce test à faible coût par écouvillonnage respiratoire permet de diagnostiquer les infections à Covid-19 en 45 minutes environ et ne nécessite aucun équipement spécialisé. Grâce à un calendrier de développement considérablement accéléré, le test pourrait bientôt prendre en charge des régimes de test de coronavirus à grande échelle dans le monde entier.

Le Dr Charles Chiu de l'Université de Californie, École de médecine de San Francisco, qui dirige le développement du nouveau test en collaboration avec les scientifiques de Mammoth Biosciences, considère que ce nouveau diagnostic pourrait changer la donne. Il a déclaré :

"C'est le premier test de diagnostic de l'infection à Covid-19 basé sur le CRISPR. Je le considère comme une alternative viable aux tests RT-PCR couramment utilisés qui sont actuellement disponibles"

Forces et faiblesses

La plupart des tests Covid-19 actuels sont basés sur la réaction en chaîne de la transcriptase polymérase inverse (RT-PCR), dont les taux de spécificité et de sensibilité sont de 90 % et plus. L'inconvénient est que le test ne peut être effectué que dans des laboratoires bien équipés, ce qui signifie que la durée minimale du test est généralement d'environ 4 heures, et peut être beaucoup plus longue. Les tests PCR étant réalisés à grande échelle, les réactifs utilisés dans le test sont également rares. A déclaré Charles Chiu :

"Par rapport aux autres tests qui détectent directement le Coronavirus, le test CRISPR est plus rapide, plus portable, utilise différents réactifs et peut être immédiatement utilisé pour deux applications. La première est le dépistage rapide et à haut débit de centaines d'échantillons d'écouvillons respiratoires à la fois, dans l'espoir d'atténuer la crise des tests aux États-Unis et dans le monde. La seconde est destinée à être utilisée dans des lieux de soins tels que les urgences, les cliniques de soins d'urgence, ou même à domicile grâce à l'utilisation de cartouches et de bandelettes réactives jetables"

Outil gratuit

Les systèmes basés sur le CRISPR ont déjà été largement utilisés par les chercheurs pour modifier le matériel génétique des cellules vivantes. Dans le nouveau test, appelé test SARS-CoV2 DETECTR, un système appelé CRISPR-Cas12 est utilisé pour reconnaître les signatures génétiques du coronavirus Covid-19. Si et quand il trouve les gènes, l'outil commence à couper, provoquant une réaction qui change la couleur de la jauge - un processus quelque peu analogue à la façon dont fonctionne un test de grossesse en vente libre.

Bien que le nouveau test soit légèrement moins sensible que les tests basés sur la PCR, les chercheurs affirment qu'il est peu probable que cela ait un grand impact sur le diagnostic car les patients infectés par Covid-19 ont généralement une charge virale élevée. A déclaré Charles Chiu :

"A court terme, je pense que le nouveau test complétera les tests PCR, et ne les remplacera pas. Chacun d'entre eux présente actuellement des forces et des faiblesses. Nous avons terminé la validation du test dans un laboratoire clinique et nous soumettons maintenant le test à la FDA pour une autorisation d'utilisation d'urgence. Le délai pour la mise à disposition commerciale et publique du test a été vraiment accéléré - moins d'un mois pour son utilisation dans les laboratoires cliniques, et dans les trois à quatre mois pour son utilisation dans les points de service"

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