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Pendant que les essais d'ADN deviennent plus communs, les chercheurs ajoutent rapidement l'équipement pour continuer

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À moins que votre garde-robe de carrière se compose des manteaux blancs multiples de laboratoire et votre bureau a une cachette des tubes à essai, vous ne vous rappelez pas probablement où vous étiez quand on lui a annoncé que le génome humain avait été ordonnancé.

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Mais, si vous savez que vous pouvez maintenant bomber $100 pour tracer votre migration héréditaire par l'histoire, le terme « ADN » peut tomber la langue comme l'ABCs.

La montée subite dans la recherche génétique et son acceptation croissante en le grand public présage bien pour des découvertes de santé, d'agriculture et de ressources naturelles — sans compter des enthousiastes de généalogie. Ceci a des scientifiques trottinant pour suivre la technologie, selon Charlie Johnson, directeur de la génomique et de la bio-informatique chez le Texas A&M AgriLife Research dans College Station.

C'a été 20 par an plus productifs depuis que deux génomes bactériens ont été la première fois ordonnancés en 1995, selon les instituts nationaux du centre Santé-national pour l'information de biotechnologie. Presque 125 000 organismes ont été ordonnancés, incluant — pour aider ponctuel votre ascendance — le génome humain en 2003.

« La technologie est relativement nouvelle. Avant 2007, l'ordonnancement était très difficile, lent et laborieux, » Johnson a dit. « Le Projet génome humain, par exemple, a commencé en 1990 et a pris 13 ans pour accomplir à un coût d'environ $3 milliards. »

Une fois que la science obtenait une prise de la technologie, cependant, les chercheurs de l'agriculture à la zoologie ont clairement vu comment scruter dans le niveau les plus secrets de l'existence d'un organisme pourrait aider à aborder des questions telles que la maladie, la sécheresse et la peste.

Un problème, cependant, a été coûté, Johnson a noté.

« Le genre d'instruments requis pour faire l'ordonnancement ne sont pas abordable pour qu'un laboratoire simple possède, » il a dit. « Sur la moyenne, ils ont coûté environ $1 millions la pièce. Et il serait difficile que n'importe quel un investigateur produise d'assez de travail de recherches pour justifier cet investissement. »

La recherche d'AgriLife, avec son réseau scientifique étendu à travers le Texas, a envisagé une plus grande image. En 2010, l'agence a loué Johnson pour établir un noyau central d'équipement et d'un ensemble de scientifiques expérimentés de technologie de génomique qui pourraient soutenir des chercheurs dans un rentable, moyen efficace. Encore plus, ils fournissent leur expertise aux scientifiques dans l'ensemble du Texas A&M University System.

« Notre réputation pour l'excellence scientifique et les données de haute qualité a mené aux collaborations avec des scientifiques autour du monde, y compris des groupes dans 35 pays, » Johnson a noté. « Commençant en 2009 quand la première prochaine génération ordonnançant le système a été achetée et au cours des huit dernières années, AgriLife a continué à suivre une technologie qui change tellement rapidement. On s'attend à ce que le coût d'ordonnancement a chuté de $3 milliards pour le premier génome humain moins de $1 000 à aujourd'hui et plonge en-dessous de $100 dans les années à venir. »

Ce mois, le centre mettra en place un Illumina NovaSeq 6000, une machine Johnson a indiqué peut rapporter l'équivalent de 48 génomes de taille humaine en moins de deux jours. Ceci réduira de manière significative des coûts.

Le « Texas A&M AgriLife est l'une des premières institutions académiques pour avoir accès à cette technologie, » Johnson a dit. « C'est l'outil droit au bon moment pour faire face à cette nouvelle ère de grande agri-génomique, et nous sommes captivés pour faire partie de lui. »

Essentiellement, comme son téléphone portable, l'ADN ordonnançant la technologie est changeante à un rythme frénétique, il a dit.

« Si vous n'améliorez pas constamment, vous êtes en retard rapidement. Nous travaillons dur pour obtenir ces nouvelles machines ainsi nous pouvons continuer à fournir les données les plus de haute qualité utilisant les dernières technologies genomic pour donner à nos collaborateurs le plus grand coup pour le mâle, » il a dit.

Le centre a plus de 350 investigateurs principaux dans la collaboration et s'est développé « de faire essentiellement quelques projets une année maintenant à ajouter fondamentalement un projet par jour, » Johnson a noté.

Et l'ordonnancement de génome est seulement une partie de l'effort. L'équipe de Johnson a également un programme en cours d'utilisation de recherche de bio-informatique, fournissant l'analyse de données pour des chercheurs.

Le « ordonnancement de génome produit une masse de données, » il a dit. « Imaginez une pile de bibliothèque d'encyclopédies. Rectifiez-les dans un destructeur de papier, et vous finissez avec des ficelles des lettres. Le défi est de remettre tout ceux ensemble dans le livre qui décrit ce que vous avez ordonnancé. Alors vous pouvez employer cette information pour faire une certaine découverte ou pour découvrir quelque chose utile. »