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#Actualités du secteur
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Paysage Genomic fonctionnel d'AML Analyzed
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La leucémie aiguë myéloïde est un cancer de la ligne myéloïde des globules sanguins, caractérisée par la croissance rapide des cellules anormales qui s'accumulent dans la moelle et le sang et interfèrent les globules sanguins normaux.
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L'exécution des thérapies visées pour la leucémie aiguë myéloïde (AML) avait contesté en raison des modèles mutational complexes dans et à travers des patients aussi bien qu'une pénurie d'agents pharmacologiques pour la plupart des événements mutational.
Scientifiques ordonnancement utilisé d'Oregon Health et d'Université des Sciences (Portland, OU, Etats-Unis) à exome, ARN ordonnançant, et/ou ex vivo sensibilité de drogue examinant pour profiler jusqu'à 672 échantillons de tumeur provenant de 562 patients d'AML. En plus d'identifier des mutations récurrentes non décrites dans la condition précédemment, elles ont découvert les modèles de réponse de traitement qui ont correspondu aux signatures spécifiques de combinaisons ou d'expression du gène de mutation.
En tant qu'élément d'un programme appelé l'AML battu, l'équipe a fait l'exome d'Illumina HiSeq 2500 d'appareiller-fin ordonnançant sur 622 des échantillons de tumeur. Ils ont également exécuté l'ARN ordonnançant sur 451 échantillons de tumeur provenant de 411 patients d'AML, et la sensibilité de drogue examinant avec 122 drogues sur 409 échantillons de tumeur provenant de 363 patients d'AML.
L'équipe a découvert des profils de transcriptome liés aux mutations de tumeur ou aux sous-ensembles fréquents de tumeur avec les configurations cytogénétiques spécifiques, aussi bien que des combinaisons d'expression du gène et de mutation actuelles où les tumeurs ont fait ou n'ont pas fait réponse à de diverses drogues. Là où la résistance au médicament était commune dans les tumeurs contenant des mutations dans TP53, NRAS, KRAS, IDH1, ou le gène transcriptional ASXL1 de régulateur-codage, elles ont noté que les tumeurs IDH2 mutation-positives tendues vers la sensibilité de drogue. L'analyse de l'équipe a également accentué des sensibilités spécifiques de drogue correspondant aux traitements visés tels que la kinase de CARTE, le PIK3C, le mTOR, ou les inhibiteurs de JAK. C'et d'autres données sont à la disposition d'autres scientifiques en ligne par une visionneuse de données ont appelé Vizome.
Jeffrey Tyner, le doctorat, un professeur agrégé et l'auteur important de l'étude, ont dit, « « notre ensemble de données peut être utile pour voir si cette mutation génique particulière correspond à certaines sensibilités de drogue. Nous croyons que cet ensemble de données aidera des médecins à résoudre ces genres spécifiques de questions plus facilement. » L'étude a été éditée le 17 octobre 2018, dans la nature de journal.