{{{sourceTextContent.title}}}

Un nouveau test pour les coronavirus fournit des résultats rapides et précis

{{{sourceTextContent.subTitle}}}

Un nouveau test produit des résultats en deux heures environ au lieu d'attendre des jours pour avoir des nouvelles des installations de test à distance

{{{sourceTextContent.description}}}

Le laboratoire ésotérique et moléculaire du département de pathologie du Medical College of Georgia a mis au point un nouveau test coronavirus précis qui peut dire aux patients s'ils sont infectés dans un délai d'environ deux heures au lieu d'attendre généralement des jours pour avoir des nouvelles des installations de test à distance.

"Nous voulons que les patients et les médecins de notre communauté aient accès en temps voulu à DeepL à des informations qui, en fin de compte, nous seront toutes utiles en contribuant à limiter la propagation du virus", déclare le Dr Ravindra Kolhe, directeur du laboratoire GEM, chef de la section de pathologie moléculaire et génétique et vice-président de la recherche translationnelle au sein du département de pathologie du MCG de l'université d'Augusta.

"Une identification plus rapide des personnes infectées permettra de s'assurer qu'elles reçoivent l'aide dont elles ont besoin et que le risque d'exposition à d'autres personnes est considérablement réduit", déclare M. Kolhe à propos du test rapidement mis au point par l'équipe du GEM Lab ces derniers jours.

"Nous avons terminé la validation de notre test COVID-19 dimanche et avons immédiatement soumis la documentation à la FDA pour son approbation. Ce fut un effort ininterrompu de 90 heures de la part de l'équipe phénoménale du laboratoire GEM pour développer ce test, mais nous avons tous senti un engagement envers notre communauté pour rendre ce test disponible ici", dit Kolhe. Alors que l'approbation de la Food and Drug Administration est en attente pour le nouveau test, la FDA a publié cette semaine de nouvelles directives selon lesquelles son approbation n'est plus nécessaire pour les tests COVID-19 dans un laboratoire certifié CLIA comme le laboratoire GEM. Le CLIA est un centre de certification des services de Medicare et Medicaid.

"Comme nous l'avons tous vu dans les médias, l'identification des individus infectés par ce virus en quelques heures et le lancement du protocole de quarantaine peuvent avoir un impact énorme sur la propagation de l'infection et potentiellement sur l'état des patients", explique Kolhe. "Nous effectuons maintenant des tests 24 heures sur 24."

L'équipe du GEM Lab comprend le Dr Ashis Mondal, superviseur du laboratoire ; Kimya Jones, responsable du laboratoire ; les associés de recherche Sudha Ananth et Yasmeen Jilani ; les docteurs Pankaj Ahluwalia, Nikhil Sahajpal et Meenakshi Ahluwalia, tous en post-doctorat ; et le Dr Allan Njau, chercheur en pathologie moléculaire.

Bien que la priorité soit de fournir des résultats rapides et précis aux résidents locaux, M. Kolhe indique que son laboratoire aimerait également tester des échantillons provenant de l'extérieur de la zone immédiate lorsque cela lui est demandé, mais ces détails sont encore en cours d'élaboration. Pour l'instant, le test est destiné aux patients dont les échantillons sont prélevés dans le cadre du système de santé de l'UA.

Pour répondre rapidement à la demande, l'équipe du GEM Lab travaille maintenant 24 heures sur 24 pour augmenter sa capacité d'essai, qui a commencé à 72 tests sur une période de 24 heures et qu'elle veut étendre à 500 dans les semaines à venir. Le MCG GEM Lab travaillera également avec d'autres laboratoires certifiés par la CLIA intéressés à proposer leur nouveau test.

Leur nouveau test, qui fonctionne sur la plateforme du laboratoire Luminex ARIES, est basé sur les recommandations modifiées des Centers for Disease Control and Prevention, explique M. Kolhe, et se concentre sur deux marqueurs génétiques uniques pour le virus virulent.

"Pour les tests, nous nous intéressons à une région conservée qui est unique pour le coronavirus 2019, qui n'a pas été modifiée dans ce virus et qui est fondamentale pour sa survie", déclare M. Kolhe à propos des deux marqueurs génétiques, N1 et N3. Les marqueurs génétiques sont des séquences d'ADN qui sont des points de variation distincts pouvant être utilisés pour identifier un être humain ou une maladie.

L'analyse génétique du laboratoire du MCG, appelée test in silico, a également montré que N1 et N3 étaient caractéristiques du coronavirus 2019, et l'équipe du GEM cherche maintenant d'autres marqueurs qui pourraient également être considérés comme uniques à ce virus.

"Tout le monde regarde ces objectifs et chacun a une façon différente de les regarder", dit Kolhe. "Le plus grand changement dans ce domaine est le délai d'exécution pour les patients, car nous sommes en mesure de fournir le test localement" Le test indique également la charge virale présente, et des charges plus élevées augmentent les chances de cette personne d'infecter d'autres personnes.

"Nous voulons identifier les patients qui ont une charge virale élevée et qui peuvent propager le virus rapidement. Nous voulons prévenir #patient31 à Augusta", déclare Kolhe, en faisant référence à une femme en Corée du Sud qui aurait considérablement augmenté la propagation du virus dans ce pays en entrant en contact avec de nombreuses autres personnes dans une foule importante, notamment lors de deux grands services religieux et en dînant à un buffet, avant d'être testée. Quelques jours auparavant, elle avait fait un petit accident de voiture qui l'avait amenée à l'hôpital, mais elle n'y avait pas été testée pour le coronavirus.

Jusqu'à présent, un échantillon de patient de la région d'Augusta était prélevé, mis dans un avion pour un laboratoire de référence, où le traitement pouvait prendre trois à quatre heures, dit-il, mais le vrai problème est la proximité et le temps de trajet jusqu'à ce laboratoire.

Pour le premier test en temps réel effectué le week-end dernier, l'équipe du GEM Lab a commencé à analyser l'échantillon à 22 heures et en a rapporté le statut peu après 2 heures du matin aux médecins de l'AU Health System. Ces premiers tests ont finalement confirmé les premiers cas d'infection signalés dans la région d'Augusta.

Bien que le test de détection des coronavirus soit en grave pénurie en raison de l'escalade rapide et de la demande inattendue, les composants individuels nécessaires pour effectuer un test ne sont pas encore aussi demandés. Le travail de l'équipe du GEM Lab a donc consisté à trouver les pièces nécessaires, comme les cassettes d'extraction dans lesquelles ils ont placé l'échantillon du patient.

"L'équipe du GEM Lab a travaillé 24 heures sur 24, 7 jours sur 7, pour achever la validation et la mise en œuvre en un temps absolument record", déclare le Dr Amyn Rojiani, président du département de pathologie du GEM. "Félicitations à toute l'équipe pour son dévouement et son expertise sans compromis, qui ont permis de mettre ce test directement à la disposition de la communauté d'Augusta pour la première fois", a déclaré le Dr Amyn Rojiani, présidente du département de pathologie du MCG

Le coronavirus existe depuis au moins 40 ans, mais on en entend parler et on s'inquiète beaucoup maintenant parce que des changements dans la structure du virus l'ont rendu plus virulent et plus contagieux, dit Kolhe.

Les coronavirus sont un grand groupe de virus qui provoquent des maladies chez les animaux et les humains, selon la Fondation nationale des maladies infectieuses. Les coronavirus humains ont été identifiés pour la première fois dans les années 1960 et le nouveau COVID-19 a fait surface en Chine en 2019. La plupart des gens sont infectés par l'une des souches humaines les plus courantes à un moment ou à un autre de leur vie. Les symptômes de l'infection par COVID-19 peuvent apparaître deux à 14 jours après l'exposition et comprennent la fièvre, la toux, la difficulté à respirer et l'essoufflement.