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Le test CRISPR utilise une caméra de téléphone portable pour détecter le SRAS-CoV-2

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Les chercheurs de l'université de Berkeley ont mis au point un test rapide pour le SARS-CoV-2 qui utilise une enzyme pour cliver l'ARN viral, déclenchant un signal fluorescent qui peut être détecté à l'aide d'une caméra de smartphone, et qui peut fournir une mesure quantitative du niveau de particules virales dans l'échantillon. Le test produit un résultat en 30 minutes seulement et ne nécessite pas d'équipement de laboratoire encombrant ou coûteux.

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Les tests rapides sont essentiels pour mesurer et arrêter la propagation de COVID-19, mais les tests actuels, tels que la PCR, prennent beaucoup de temps et nécessitent un équipement de laboratoire coûteux, ce qui crée un goulot d'étranglement dans l'obtention des résultats. Les chercheurs ont développé des alternatives, et cette dernière technologie a été rapidement réorientée lorsque la pandémie a commencé. Initialement prévue pour détecter le VIH dans les échantillons de sang, les chercheurs de Berkeley ont pivoté pour permettre au dispositif de détecter le SRAS-CoV-2 dans les échantillons de prélèvement nasal.

Le test s'appuie sur le CRISPR-Cas, développé à l'origine comme une technologie d'édition de gènes. Lorsqu'une enzyme Cas13 préprogrammée est ajoutée à l'échantillon, elle peut cliver les séquences d'ARN du virus du SRAS-CoV-2. Cela entraîne le clivage d'autres séquences voisines, notamment une sonde qui libère une lumière fluorescente lors du clivage. L'appareil utilise un laser pour exciter cette fluorescence et une caméra de smartphone peut alors détecter la lumière, fournissant une mesure quantitative des particules virales présentes dans l'échantillon.

"C'est super excitant d'avoir cet aspect quantitatif dans l'essai", a déclaré Melanie Ott, une chercheuse impliquée dans l'étude. "La PCR est l'étalon-or, mais il faut passer par tellement d'étapes. Il y a ici d'énormes possibilités pour les agents pathogènes et pour la biologie en général de rendre la quantification de l'ARN plus précise"

Il est frappant de constater que le test ne dure que 30 minutes. "Notre étude montre que nous pouvons faire la partie détection de ce test très rapidement, en effectuant la mesure avec de l'électronique grand public produite en masse", a déclaré Daniel Fletcher, un autre chercheur participant à l'étude. "Nous n'avons pas besoin d'un équipement de laboratoire sophistiqué"

Cette technologie pourrait fournir une alternative viable à la PCR pour les tests COVID-19 de routine. "L'une des raisons pour lesquelles nous sommes enthousiasmés par les diagnostics basés sur le CRISPR est la possibilité d'obtenir des résultats rapides et précis au moment voulu", a déclaré Jennifer Doudna, une troisième chercheuse participant au projet. "Cela est particulièrement utile dans les endroits où l'accès aux tests est limité ou lorsque des tests fréquents et rapides sont nécessaires. Cela pourrait éliminer une grande partie des goulots d'étranglement que nous avons constatés avec COVID-19"

Voir une vidéo sur la technologie ci-dessous.