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Innovations dans le monde du séquençage

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Comment les inventions de Solis BioDyne peuvent améliorer votre séquençage de cellules uniques

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Le séquençage unicellulaire permet de découvrir la diversité cachée des cellules individuelles, transformant ainsi la recherche, du cancer aux neurosciences, mais il exige des réactifs qui protègent chaque molécule précieuse. C'est là que nos innovations entrent en jeu.

Qu'est-ce que le séquençage unicellulaire ?

Le séquençage d'une seule cellule est un ensemble de techniques qui permettent aux scientifiques d'analyser le matériel génétique - ADN ou ARN - de cellules individuelles plutôt que d'un mélange de plusieurs cellules. Cela est important car même les cellules d'un même tissu peuvent présenter des différences au niveau de l'expression des gènes, des mutations ou des états de régulation. Le séquençage en masse traditionnel fait la moyenne de ces différences, mais les approches unicellulaires nous permettent d'observer directement la diversité cellulaire.

Cette méthode permet de mesurer l'ADN (séquençage du génome d'une cellule unique), l'ARN (transcriptomique d'une cellule unique) et les marques épigénétiques (ATAC-seq d'une cellule unique, méthylation-seq).

Alors que le séquençage unicellulaire lit naturellement les acides nucléiques, les chercheurs ont développé des adaptations astucieuses pour mesurer les protéines en même temps que l'ARN ou l'ADN en convertissant les signaux des protéines en formats lisibles par l'ADN. L'approche la plus courante, utilisée dans CITE-seq et REAP-seq, repose sur des anticorps marqués par des codes-barres d'ADN uniques qui lient des protéines spécifiques ; pendant le séquençage, ces codes-barres sont capturés et quantifiés comme l'ARNm, révélant l'abondance des protéines. D'autres méthodes comprennent les aptamères d'ADN qui lient directement les protéines, les essais de ligature ou d'extension de proximité où des paires d'anticorps génèrent des étiquettes d'ADN séquençables lorsqu'elles sont liées à la même protéine, et le tri d'index par cytométrie de flux suivi d'un séquençage. Ces approches multi-omiques sont très utiles dans différents domaines. Par exemple, en neurosciences, elles peuvent permettre de distinguer des sous-types de cellules et de suivre les réponses immunitaires ou gliales en cas de maladie.

Quels produits innovants puis-je utiliser pour cette méthode ?

Dans le séquençage de l'ARN d'une seule cellule, les inhibiteurs de RNase sont essentiels pour protéger les ARNm fragiles de la dégradation par les RNases omniprésentes, qui sont libérées dès qu'une cellule est ouverte. Ils sont généralement inclus dans le tampon de lyse pour protéger les transcrits immédiatement après la rupture et sont maintenus pendant les étapes de capture de l'ARN et de transcription inverse, garantissant que l'ARN reste intact jusqu'à ce qu'il soit converti en ADNc stable. Dans certains protocoles, tels que l'ARN-seq d'un seul noyau ou le CITE-seq, les inhibiteurs de RNase sont également ajoutés pendant l'isolement des noyaux ou la perméabilisation des cellules, lorsque les membranes sont compromises et que les RNases peuvent se diffuser librement.

Notre RiboGrip® RNase Inhibitor (220 U/µl) est un produit innovant conçu pour relever ce défi. Il s'agit d'un inhibiteur à base de protéines, conçu in silico, qui inactive la RNase A, la RNase B et la RNase C.

RiboGrip® comprend également une modification génétique - Stability TAG - notre technologie exclusive et brevetée de stabilisation des polypeptides. Cette modification rend RiboGrip® extrêmement tolérant aux températures élevées et permet l'expédition à température ambiante ainsi qu'une utilisation efficace dans les essais nécessitant des températures d'incubation élevées.des tests effectués en interne montrent que RiboGrip® conserve toute son activité après une heure d'incubation à 60 °C.

Pourquoi RiboGrip® est-il un bon choix pour le séquençage unicellulaire ?

Volume de concentration élevé de 220 U/µL - idéal pour les petits volumes de réaction.
Stabilité exceptionnelle à des températures élevées : stable pendant 1 heure à 60 °C ou jusqu'à 1 mois à 25 °C - préparation pratique de la réaction.
Forte inhibition des RNases eucaryotes (A, B, C) pour une protection maximale de l'ARN.
Efficace à de faibles concentrations de DTT, préservant la qualité de l'ARN.
Prend en charge les flux de travail RT-(q)PCR et NGS basés sur l'ARN.
Ne nous croyez pas sur parole, Illumina le souligne : "RiboGrip® est le meilleur choix pour les types d'échantillons difficiles, tels que ceux ayant une faible teneur en ARN et/ou une RNase endogène plus élevée (par exemple, les plantes) Pour en savoir plus, consultez les documents de formation sur le séquençage unicellulaire.