La nouvelle méthode disco permet au séquençage cellulaire unique scrna SEQ de traiter efficacement les échantillons avec moins de cellules

La nouvelle méthode disco permet au séquençage cellulaire unique scrna SEQ de traiter efficacement les échantillons avec moins de cellules

Le séquençage de l'ARN d'une seule cellule, ou scrna SEQ en abrégé, est une technologie qui permet aux scientifiques d'étudier l'expression des gènes dans des cellules uniques au sein d'une population mixte, ce qui correspond à la façon dont toutes les cellules existent dans les tissus humains.

Faisant partie de la grande famille des technologies de séquençage de cellules uniques, scrna SEQ consiste à capturer l'ARN d'une cellule unique et à le séquencer après de multiples réactions de transformation moléculaire. L'ARN étant une étape intermédiaire entre les gènes de l'ADN et les protéines, il fournit une description des gènes qui sont actifs et de ceux qui ne le sont pas dans une cellule donnée.

Comme scrna SEQ capture l'activité de tous les gènes du génome cellulaire et qu'il capture des milliers de gènes à la fois, il est devenu l'étalon-or pour la définition de l'état et du phénotype des cellules. Ces données peuvent révéler des types de cellules rares dans les populations cellulaires, voire des types jamais observés auparavant.

Mais scrna SEQ n'est pas seulement un outil de biologie cellulaire fondamentale ; il est largement utilisé dans la recherche médicale et pharmacologique, car il permet d'identifier les cellules du tissu qui se divisent activement, ou celles qui répondent à des médicaments ou à des traitements spécifiques.

Ces méthodes de cellules uniques ont modifié notre capacité à analyser les caractéristiques des cellules d'un système à l'autre.

Cependant, le problème rencontré par les chercheurs est que scrna SEQ est actuellement adapté à l'entrée de grandes unités.

Ce n'est pas un mince problème car la méthode scrna SEQ nécessite plus de 1000 cellules pour effectuer des mesures utiles. Cela rend inefficace et coûteux le traitement de petits échantillons individuels (tels que de petits tissus ou des biopsies de patients). Ces échantillons doivent souvent être résolus en chargeant un grand nombre d'échantillons, ce qui entraîne des lectures chaotiques de la population cellulaire en mosaïque.

La solution disco

Bues, chercheur à l'Institut fédéral suisse de technologie EPFL, et une équipe composée de Marjan bio č anin et Joern pezoldt ont maintenant développé une nouvelle méthode pour permettre à scrna SEQ de traiter efficacement les échantillons avec moins de cellules. Cette méthode, publiée dans le Journal of natural methods, s'appelle disco, deterministic, mRNA capture bed and cell co encapsulation dropping system.