La détection antigénique du virus Omicron pose de grands défis en termes de rapidité et de sensibilité

La détection antigénique du virus Omicron pose de grands défis en termes de rapidité et de sensibilité

La détection du taux de détection de medRxiv est un défi majeur en termes de rapidité et de sensibilité. Selon les données préliminaires de medRxiv, la sensibilité du virus de l'allergie COVID-19 aux défis existants en matière de détection rapide d'antigènes, mais les données sont encore incertaines.

La sensibilité de la détection de l'antigène est un problème. Il semble que le processus d'infection plus rapide des souches mutantes puisse compromettre l'efficacité de la détection rapide, ce qui constitue un autre problème, en particulier l'autotest effectué par les individus avant des activités importantes.

Selon un avis publié par la Food and Drug Administration (FDA) américaine à la fin du mois de février, les premières études menées par le projet Radx des National Institutes of Health ont montré que la sensibilité de la détection rapide des antigènes aux variantes Omicron était réduite.

Cependant, il s'agit d'un très petit nombre de personnes responsables de l'analyse du projet, et Bruce n'est pas la conclusion finale.

Les données publiées par la FDA proviennent des chercheurs de Radx à l'université d'Emory. Ils ont obtenu neuf échantillons d'omones du laboratoire coopératif de l'université de Washington. Ils ont utilisé ces échantillons pour créer une série de diluants, puis ont effectué divers tests antigéniques rapides et des tests PCR. Ils ont également testé la variante delta et le virus de type sauvage.

Dans les trois cellules de test qu'ils ont fabriquées, ils peuvent diluer davantage dans la cellule delta que dans la cellule Omicron. Par rapport à Omicron, dans le cas de la variante delta, les tests antigéniques rapides peuvent détecter le virus delta à un seuil de cycle PCR plus élevé, ce qui indique que ces tests sont plus sensibles au delta.

Selon M. Tromberg, bien que cette expérience de dilution soit la première étape pour évaluer si et comment l'Omicron affecte les performances des tests rapides, l'étalon-or est d'aller dans les cliniques, de mesurer les patients réels et de prêter attention au moment où les échantillons sont prélevés après l'apparition des symptômes, et si les patients sont vaccinés et améliorés avant l'infection, car tous ces éléments sont importants.

Une diminution de la sensibilité des tests de laboratoire signifie-t-elle une diminution de la sensibilité clinique ? Cette question reste en suspens.

M. Tromberg a indiqué que ces travaux sont en cours, mais il a noté que les données cliniques recueillies jusqu'à présent ont révélé que la détection rapide était en fait plus performante dans les échantillons cliniques réels que dans les dilutions de séries mélangées.

Il reconnaît qu'il s'agit là d'un résultat contre-intuitif, mais pense qu'il peut refléter les différences entre les moments où les différents échantillons ont été prélevés au cours de l'infection. Des études antérieures ont montré que le rapport entre la protéine N et l'acide nucléique prélevé sur des échantillons d'écouvillons change au cours de l'infection. Cela signifie que la relation entre la concentration en protéines N et les valeurs pcr-ct variera en fonction du moment de l'échantillonnage au cours de l'infection. Il a ajouté qu'au cours du processus d'infection, la différence entre le temps de collecte des échantillons expérimentaux et des échantillons cliniques peut influencer les données de sensibilité apparente. Omicron infecte les individus beaucoup plus rapidement et efficacement, ce qui pourrait signifier que les personnes devraient être testées plus tôt que les souches précédentes après l'exposition.

Il a mentionné une étude de l'université de l'Illinois, financée par Radx, qui a examiné l'efficacité des tests antigéniques rapides par rapport à la PCR dans l'environnement précoce de l'omicron. L'étude a montré que la fenêtre de détection rapide de l'infection par les antigènes était d'environ 3 à 6 jours.

"Il s'agit d'une fenêtre assez large. Ce que nous envisageons, c'est de réduire la fenêtre de détection d'Omicron" Il a ajouté : "Le taux d'attaque de ce virus est très élevé. "Le taux d'attaque de ce virus est très élevé et le meilleur délai est réduit. C'est pourquoi je recommande aux gens de faire le test dans un délai d'un ou deux jours après une infection avérée ou suspectée"

Dans le rapport de prévisualisation medrxiv de 2019 sur les maladies à coronavirus publié la semaine dernière, des chercheurs du mouvement cvid-19 et du groupe de travail social ont constaté la différence entre la détection rapide de l'antigène et la PCR dans un groupe de 30 personnes en décembre 2021.

En observant ces 30 personnes (dont 29 présentaient une délétion du gène S associée à la variante Omicron), l'étude a révélé que dans tous les cas, le jour et le deuxième jour de la détection par PCR du premier positif, la détection rapide de l'antigène produisait des résultats faussement négatifs.

Pendant cette période, la valeur pcr-ct de 28 d'entre eux était inférieure à 29, ce qui indique que la charge virale était supérieure au seuil d'infectiosité. Le deuxième jour après le test PCR positif initial, 75 % des individus étaient encore négatifs au test rapide de l'antigène, tandis que le troisième jour, plus de 80 % des sujets étaient positifs au test rapide de l'antigène, et le quatrième jour, 100 % des sujets étaient positifs au test rapide de l'antigène.

Les chercheurs ont également trouvé quatre cas de transmission lorsqu'une personne était négative au test rapide de l'antigène. L'étude a utilisé les tests binaxnow d'Abbott et quickvue de Quidel.

L'étude de l'université de l'Illinois a également observé que la détection rapide d'antigènes ne permettait pas de détecter une infection précoce comme le fait la PCR.

"Si l'on compare la sensibilité de la détection de l'antigène et de la RT-PCR salivaire quelques jours avant que la première infection ne soit positive, la sensibilité de la PCR salivaire est très élevée, de l'ordre de 80 %, et la sensibilité de l'antigène n'est que de 30 %", a-t-il déclaré. "Vous voyez la différence entre ces deux méthodes. Ce n'est donc pas étrange

Un article publié la semaine dernière dans le New England Journal of Medicine a également mis en évidence le fait que, quel que soit le type de mutation COVID-19 en cause, les produits de détection rapide d'antigènes manqueront de nombreux patients le premier jour de l'infection.

Blythe Adamson, premier auteur de la recherche medrxiv, a déclaré que dans son travail, elle a constaté que l'efficacité de la PCR et de la détection rapide d'antigènes a diminué. Ce déclin n'est pas nécessairement dû à la baisse des performances de la détection elle-même, mais à l'infection rapide des individus par Omicron, qui réduit l'efficacité de la détection antigénique pour les individus avant la transmission du virus.

"Pour Omicron, quelqu'un détectera un faux négatif et nous trouverons l'infection (transmise par des individus apparemment négatifs) au bout de 12 à 24 heures, ce qui est beaucoup plus rapide que ce que nous observons pour n'importe quelle autre variante", a déclaré M. Adamson

"Pour cette raison, j'ai commencé à craindre que les tests rigoureux et les protocoles de sécurité que nous avons utilisés ne soient plus suffisants pour répondre aux besoins d'Omicron", a-t-elle ajouté. "C'est pourquoi, pendant un certain temps, sur ces lieux de travail, non pas à des fins de recherche, mais à des fins de sécurité, nous avons ajouté la détection quotidienne d'antigènes à la détection quotidienne de la PCR

L'émergence d'Omicron soulève la question de l'utilité des tests antigéniques rapides pour déterminer si les individus peuvent participer en toute sécurité à des activités importantes sans s'inquiéter d'une infection ou d'une transmission du virus.

"Lorsque nous essayons de sélectionner des personnes pour des activités à haut risque, nous devons être très prudents. S'ils ne présentent aucun symptôme, le test rapide de l'antigène n'est peut-être pas un bon outil pour s'assurer qu'une personne est négative et non infectieuse avant de participer à une fête", a-t-elle déclaré

Tromberg estime que ces tests sont toujours utiles, mais recommande une utilisation régulière et continue plutôt que des contrôles ponctuels avant des réunions ou des événements.

Dans l'ensemble, l'efficacité de la détection rapide d'antigènes pour prévenir la propagation du COVID-19 au niveau de la population n'a été que très peu prouvée. Certains observateurs attribuent cette situation à l'absence de bonnes méthodes d'utilisation de ces tests.